AlphaFold2的技术突破与科学影响 - 谷歌DeepMind推出的AlphaFold2于2020年11月问世，能够仅根据氨基酸序列精准预测蛋白质三维结构，其上一代版本2018年发布但预测准确率有限[3] - 2021年7月DeepMind团队在Nature期刊发表论文公布AlphaFold2开源代码和完整方法论[4] AlphaFold2的实际应用案例 - 维也纳大学Andrea Pauli团队利用AlphaFold-Multimer（2021年10月推出）发现精子和卵子结合中关键的三种蛋白质TMEM81、IZUMO1和SPACA6，颠覆之前认为只需两种蛋白质的观点[7][8] - 该研究发现TMEM81-IZUMO1-SPACA6蛋白质复合物分别与哺乳动物卵子上的JUNO蛋白或鱼类卵子上的Bouncer蛋白结合，介导精子-卵子结合[10] - Andrea Pauli表示AlphaFold加快了发现速度，如今每个项目都会使用该工具[12] AlphaFold2的全球采用数据 - 全世界190多个国家的约330万用户访问了EMBL-EBI托管的AlphaFold数据库，其中超过100万用户来自低收入和中等收入国家[15] - 该数据库包含超过2.4亿个蛋白质结构预测结果，涵盖地球上几乎所有已知蛋白质[15] - 描述AlphaFold2的Nature论文已获得接近4万次引用，研究人员兴趣未减退[12] - 超过20万项研究直接或间接使用AlphaFold，涉及近80万名科学家工作[24] AlphaFold2的行业影响 - 结构生物学领域使用AlphaFold的研究人员向蛋白质数据库提交的蛋白质结构数量比未使用者高出约50%[18] - 在计算生物学领域，几乎每场学术会议报告都会提到AlphaFold，在AI辅助药物发现和AI蛋白质设计等计算密集型领域有良好应用[21] - AlphaFold开辟了新的研究方向——AI蛋白质设计，带来了新的关注和资金投入[21] - AlphaFold2开始帮助研究人员解开疾病生物学机制，2024年发布的AlphaFold3能预测潜在疗法与蛋白质相互作用，更有助于药物发现[24]

AlphaFold的技术突破 - 解决了困扰人类50年的蛋白质结构预测难题，仅凭氨基酸序列即可在几分钟内计算出蛋白质的精确3D空间结构[4] - 预测结果与实验图像高度吻合，在CASP14竞赛中表现突出，标志着结构生物学研究范式的根本转变[4] - AlphaFold 3进一步实现了从单一蛋白质结构预测到生命体系建模的跨越，能同时模拟蛋白质、DNA、RNA和小分子配体之间的相互作用[21] 工具的普及性与可及性 - AlphaFold数据库已免费开放，包含超过2亿条结构预测，传统实验方法完成同等数量需数百万年[5] - 全球约330万研究者使用该工具，用户遍布190多个国家，其中超过100万来自中低收入地区[6] - 工具的免费和易用性显著降低了科研门槛，使非顶尖实验室的研究人员也能进行原子级结构研究[9] 科研效率与产出的提升 - 使用AlphaFold的研究者提交的新型蛋白质结构数量比对照组高出约40%，实验结构提交量高出约50%[16][17] - 具体案例显示，土耳其本科生借助该工具完成了15篇膜蛋白结构研究，将原本需数年的项目压缩为高效计算任务[1][9][11] - 在斑马鱼卵子蛋白Bouncer的研究中，模型快速预测出关键相互作用蛋白Tmem81，加速了“精子识别卵子”机制的解析[11][13] 应用领域的扩展与转化价值 - 在基础研究领域，成功解析了与动脉粥样硬化相关的apoB100蛋白和肿瘤相关蛋白p53等复杂结构[14][16] - 在药物研发中，AlphaFold 3的原子级全景视图被直接集成到设计流程，用于候选药物筛选和靶点相互作用分析[21] - 在农业和生物技术领域，工具被用于解析蜜蜂免疫蛋白Vitellogenin、植物环境感知蛋白等，将多年研究压缩至几周[23][25] 行业影响与趋势变化 - 结构生物学从依赖昂贵设备的“验证区”转向数据驱动的“探索区”，研究重点向更复杂、高风险的课题偏移[16][17] - AlphaFold相关研究被临床论文引用的概率是传统结构生物学工作的两倍，专利引用率也显著更高[20] - 工具持续被新项目复用，其2021年核心论文引用曲线未出现常规下滑，显示出长期生产力工具特征[17][20]

学术报告与个人回顾 - 颜宁在上海交通大学大师讲坛作学术报告《CryoSeek（酷寻）——以结构为先导的生物学发现新范式》，探讨AI与科研的关系等热点问题 [1] - 回顾主要学术生涯，并提及将于近期发布讲座核心内容 [1] 回国决策的心路历程 - 以“还债的心态”做出回国决定，认为个人成就得益于天时地利人和以及国家基础研究投入的跃升 [3] - 2007年回国时赶上国家对基础研究投入大幅增加，清华对年轻人没有论资排辈，保护得非常好，使得一批年轻人取得良好成果 [3] - 在个人处于相对稳定状态时，认为应该服务于下一代年轻人，这是一种传承 [3] 职业梦想的演变与传承 - 本科毕业时梦想被请回清华任教，该梦想提前10年实现；离开普林斯顿时梦想50多岁被请回去任教，该梦想又提前至少10年实现 [6] - 新梦想是搭建平台支持更多学者，将个人幸运复制延伸，让更多年轻人无后顾之忧地发掘潜力，做出原创性发现 [7][8] - 经历人生三阶段：吸纳、证明、输出，现已进入第三阶段，目标是搭建平台支持优秀学者应对人类健康挑战 [8] 深圳医学科学院（SMART）的使命与愿景 - 深圳医学科学院是集科研、转化、经费资助、学生培养于一体的新型研发机构，英文简称SMART [9] - 现代医学已成为多学科高度交叉的复杂学科，SMART的重要使命是打通病床到实验室到制药公司再回到病床端到端的联系 [9][11] - 目标不仅是产生原创研究突破，还要创立科学机制，在保障科研专注的同时有效帮助成果转化 [11] - 愿景是经过一代人、几代人的努力，在十年、二十年后使深圳在世界生物医药版图上占有重要一席之地 [13] 选择深圳的原因 - 深圳年轻、充满活力，一切皆有可能 [12] - 最初顾虑深圳是“卷都”，但实际体会到其宜居的一面，如周末可爬山、划船、看书等 [12] - 更同意深圳是“梦都”，即梦想之都 [13] 科研合作与案例分享 - 分享与制药公司合作的研究案例：通过冷冻电镜技术发现索非布韦与胺碘酮联合使用导致心动过缓的结构生物学机制 [10] - 该发现首次揭示两种常用药利用蛋白做脚手架影响蛋白正常功能，对药物开发和疾病治疗有重要启示 [11] - 过去十几年任何时间都与一到两间国际药企有合作，体现生、医、药的密切合作 [11]

财务业绩摘要 - 2025年第三季度营业收入36.45亿元，环比增长9.1%，同比增长13.4% [2] - 2025年第三季度归母净利润4.4亿元，环比增长11.0%，同比增长42.5% [2] - 2025年第三季度经调整净利润4.71亿元，环比增长15.9%，同比增长12.9% [2] - 2025年前三季度营业收入100.86亿元，同比增长14.4% [2] - 2025年前三季度归母净利润11.41亿元，同比下降19.8%（主要因2024年第二季度处置PROTEOLOGIX股权产生高基数影响）[2] - 2025年前三季度经调整净利润12.27亿元，同比增长10.8% [3] - 2025年前三季度新签订单同比增长超过13%，增速较上半年进一步加快 [3] - 2025年前三季度经营活动现金流量净额24.36亿元，自由现金流5.36亿元（已达2024年全年规模）[3] 业务板块表现 - 实验室服务：第三季度收入21.11亿元（环比增3.7%，同比增14.3%），前三季度收入60.04亿元（同比增15%），毛利率维持在约45%，新签订单同比增长超12% [3] - CMC（小分子CDMO）服务：第三季度收入9.03亿元（环比增29.6%，同比增12.7%），前三季度收入22.93亿元（同比增16%），第三季度毛利率34.6%（环比提高4个百分点），新签订单同比增长约20% [3] - 临床研究服务：第三季度收入5.01亿元（环比增1.7%，同比增8.2%），前三季度收入14.4亿元（同比增10.3%）[4] - 大分子和细胞与基因治疗（CGT）服务：第三季度收入1.25亿元（环比增10.6%，同比增25.1%），前三季度收入3.36亿元（同比增8.1%），该板块处于业务拓展初期，宁波大分子产能于2024年第二季度投产 [4] 客户与区域分布 - 前三季度来自全球前20大制药企业（MNC）的收入同比增长37.9%，占整体收入的18% [3] - 按客户区域划分：北美客户收入占64%（同比增11.9%），欧洲客户收入占19%（同比增23.2%），中国客户收入占15%（同比增16.1%），其他地区客户收入占2% [3] - 按产能区域划分：中国实验室和工厂收入占88%（同比增14.8%），海外实验室和工厂收入占12%（同比增11.6%）[3] - 新增客户贡献收入占比约3% [3] 战略发展与并购 - 公司拟收购无锡佰翱得生物科学股份有限公司，以完善“全流程、一体化、国际化、多疗法”服务平台 [5] - 佰翱得专注于药物发现服务，具备从基因到蛋白到冷冻电镜结构的全方位服务能力，为全球少数CRO标杆企业之一 [5][7] - 收购协同效应包括：强化结构生物学与生物科学业务融合、增强大分子蛋白制备能力、整合AI技术平台提升数据解析效率 [6][8][9] - 2025年资本支出（CAPEX）计划为二十多亿元，主要用于中国区实验室服务和小分子CDMO产能建设（如北京实验室新产能、绍兴二期），未来CAPEX预计维持二十多亿规模，经营现金流可覆盖支出 [9] 运营展望 - 实验室服务增长加速得益于与MNC客户战略合作深化及中小客户需求韧性，新分子类型业务增长快但占比仍低 [9] - CMC板块毛利率预计四季度继续提升，全年毛利率预计略高于去年同期的33% [9] - 公司持续加强新技术投入（如类器官、AI等），未来可持续实现正自由现金流 [9]

投资评级 - 报告未明确给出投资评级 [1] 核心观点 - 公司实验室服务和CMC业务持续强劲增长，新签订单表现良好，并上调了全年收入增长目标 [2][3] - 公司拟收购佰翱得，以拓展结构生物学业务，预计将产生显著的协同效应 [4][5] - 随着美联储进入降息周期，公司业绩有望实现边际加速 [3] 财务业绩总结 - 2025年前三季度公司实现营业收入10086亿元，同比增长144% [1] - 2025年前三季度公司实现归母净利润1141亿元，同比下滑198% [1] - 2025年前三季度公司实现经调整归母净利润1227亿元，同比增长108% [1] - 2025年第三季度单季实现营业收入3645亿元，同比增长134%；实现归母净利润440亿元，同比增长425% [1] 分业务表现 - 实验室服务：2025年前三季度收入6004亿元，同比增长150%，毛利率451%，同比提升03个百分点，新签订单同比增长12%以上 [2] - CMC服务：2025年前三季度收入2293亿元，同比增长160%，毛利率321%，同比提升13个百分点，新签订单同比增长约20% [2] - 临床研究服务：2025年前三季度收入1440亿元，同比增长103%，毛利率118%，同比下降14个百分点 [2] - 大分子和细胞与基因治疗服务：2025年前三季度收入336亿元，同比增长81%，毛利率-491%，同比下降63个百分点 [2] 客户与区域分析 - 分客户：2025年前三季度来自全球前20大制药企业客户的收入同比增长379%，占比约18%；来自其他客户的收入同比增长103%，占比约79% [2] - 分区域：2025年前三季度来自北美客户的收入占比约64%，同比增长119%；来自欧洲客户的收入占比约19%，同比增长232%；来自中国客户的收入占比约15%，同比增长161% [3] 盈利预测 - 预计2025年营业收入14086亿元，2026年16203亿元，2027年18647亿元 [6][7] - 预计2025年归母净利润1671亿元，2026年2021亿元，2027年2423亿元 [6][7] - 预计2025年EPS为094元，2026年114元，2027年136元 [6][7] - 对应2025年PE为3624倍，2026年2996倍，2027年2498倍 [6][7]

技术平台与策略 - 颜宁团队提出名为CryoSeek的新策略，将冷冻电镜作为观察工具，结合人工智能辅助的自动建模和生物信息学分析，以发现自然界中完全未知的新型生物实体[3] - CryoSeek策略利用冷冻电镜从任何可获取的来源发现新的生物实体，并辅以人工智能辅助的数据处理和生物信息学分析[6] - 该策略与Ahaha算法形成完美互补，共同构成一个从发现生物实体到解析其高精度原子结构的完整研究路线[16] 科学发现与应用 - 使用CryoSeek策略对清华荷塘的滤过水样进行分析，发现了5种新型糖纤维的高分辨率结构，分辨率达3.0-3.5 Å，足以看清原子级别细节[8] - 这些糖纤维结构展示了从完全由蛋白质构成到完全由糖类构成的连续性结构多样性，揭示了糖类在生物大分子组装中前所未有的核心作用[8][9] - 研究发现糖介导的相互作用是不同纤维组装的关键力量，表明糖类本身具备形成复杂、有序的高阶结构的能力，颠覆了传统上认为蛋白质是生物结构主要构建者的观念[11] - 该发现提供了糖蛋白纤维从"蛋白质为主"到"纯糖"的连续结构谱系，为糖生物学开辟了新的研究方向[4][11] 算法工具与突破 - 团队开发了名为Ahaha的简单高效算法，专门用于在冷冻电镜中测定糖纤维的绝对手性，并已成功应用于天然样品的原子模型构建[12][14] - Ahaha算法已部署为一项在线网络服务，方便全球科学家使用，突破了天然糖复合物结构解析的瓶颈[12][16] - 该算法解决了糖科学领域难以获取高分辨率三维结构及测定绝对手性的根本性挑战，是专为糖样本设计的解决方案[12][14]

讣告基本信息 - 分子生物物理学家、中国科学院院士王大成先生于2025年9月19日10时02分在北京逝世 [1] - 逝世原因为因病医治无效，享年85岁 [1] 学术贡献与行业影响 - 王大成先生为我国结构生物学的开创与发展作出了杰出贡献 [4] - 其学术思想、组织贡献和育人精神将长久地影响和激励后来者 [4] - 他的逝世是我国生命科学研究领域的重大损失 [4] 组织职务与工作 - 王大成先生曾任中国科学院生物物理研究所原副所长、中国生物物理学会原副理事长 [1] - 在中国生物物理学会工作期间，积极推动学会建设和学科发展，并长期担任《生物化学与生物物理进展》主编 [4]

科研设施升级 - 武汉大学科研公共服务条件平台成功安装布鲁克800 MHz固体宽腔核磁共振系统 [1] - 该系统为亚太地区首台成功交付的同类设备 [2] - 设备将显著提升平台的高场固体核磁分析能力 [2] 研究领域拓展 - 新系统将增强平台在有机、无机、聚合物、蛋白质、药物、电池等研究领域的服务能力 [1] - 设备为结构生物学、材料科学、清洁能源等前沿领域研究提供强大支撑 [2] 技术地位 - 此次安装标志着武汉大学在高端科研设施领域迈入新阶段 [1][2]

文章核心观点 颜宁回应未任职山东大学，称学术委员会与任职无关，同时透露深圳医学科学院将与山东大学密切合作 [1][2][3] 分组1：颜宁回应任职情况 - 3月11日颜宁转发“任职山东大学”报道微博回应“并没有”，称学术委员会与任职无关，是学术界公共服务常见形式，勿过度解读 [1][2] 分组2：深圳医学科学院与山东大学合作 - 颜宁透露深圳医学科学院将与山东大学有非常多密切合作，稍后发布靠谱新闻 [3] 分组3：颜宁个人履历 - 1977年11月出生于山东章丘，2000年本科毕业于清华大学，2004年博士毕业于普林斯顿大学，2005 - 2007年在普林斯顿大学从事博士后研究，2007年任清华大学教授、博导，2017年获任普林斯顿大学雪莉・蒂尔曼终身讲席教授，2022年归国创办深圳医学科学院，2019年及2023年分别当选美国国家科学院外籍院士及中国科学院院士 [3] 分组4：颜宁科研贡献 - 实验室率先阐明几种关键膜蛋白原子结构，为药物研发提供启示，研究成果发表于顶尖学术期刊，两度被《科学》评为十大科学突破之一，研究影响延伸到医学实际应用 [4]