研究核心成果 - 一项历时13年的古DNA研究揭示了石峁古城人群的遗传来源与社会结构，研究成果于《自然》杂志发表，被评价为在东亚地区开创了运用古DNA方法揭示史前社会阶级分化与人祭现象的研究先河 [1][4] 研究背景与方法 - 研究旨在解答关于石峁遗址人群遗传来源、与周边人群联系及社会组织形式等长期争议的科学问题 [1] - 研究团队与考古发掘同步，历时13年，对来自石峁遗址、周边遗址及晋南地区共169例古代人骨样本展开大规模、高分辨率核基因组研究 [1][4] - 研究构建了科学的数据集，在时间上覆盖从仰韶晚期到石峁主体及更晚时期，在空间上覆盖石峁核心区、周边卫星遗址及晋南陶寺遗址 [4] - 通过提高数据捕获效率、降低污染获得高质量数据，并融合考古学数据进行大数据建模与交叉验证 [5] 人群遗传来源 - 基于144例无亲缘关系核基因组的分析揭示，石峁古城皇城台、内城、外城及周边卫星聚落的主体人群遗传成分高度一致，均与陕北本地仰韶晚期人群相同，表明其主体并非外来，而是在本地人群基础上发展壮大 [5][6] - 石峁文化人群与相近时期中原晋南的陶寺文化人群共享相近祖源，具有同源性 [6] - 自新石器时代中晚期以来，陕北本地与北方草原裕民成分相关人群存在长期的周期性遗传交流，但未影响主体人群的连续性 [7] - 多个石峁文化遗址的少数个体检测出10%至30%的4000多年前南方稻作人群相关遗传成分，为史前稻作农业向北传播提供了遗传学证据 [7] - 石峁文化人群以本地仰韶人群为稳定的遗传主干，同时与中原、草原和南方农牧业人群保持长期互动，为理解中华文明“多元一体”格局早期演进提供了实证 [7] 社会结构与组织 - 研究通过重建横跨四代的家族谱系，揭示了石峁社会以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式，谱系中的主要建立者均为地位较高的男性墓主，且男性墓主的配偶来自不同生物学家族 [8][9] - 石峁古城存在多元的人祭或人殉形式，反映出显著的社会阶层分化和森严的等级制度 [8] - 人祭或人殉人群存在明显性别差异：外城东门“头骨坑”内以男性为主，而高规格贵族或精英阶层的殉葬人群以女性为主 [8] - 在目前所见最高等级的皇城台墓地中，发现多对殉人间存在二级亲缘关系，表明存在一些家族或社群可能被统治阶层选中进行殉葬 [8] - 该研究为理解中国早期国家的形成发展过程提供了社会组织范本，为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶层构成提供了首个直接的遗传学证据 [9] 近期考古进展 - 近年来石峁遗址考古工作主要集中在厘清宫城区布局和发掘皇城台墓地 [12] - 皇城台区域被确认为石峁城的核心宫城区，2022年已辨明宫门、东护墙、高等级建筑群大台基等基本结构 [12] - 2022年以来，在大台基以西探明了一处大型石峁文化墓地（皇城台墓地），并在其与大台基之间发现可能与祭祀活动相关的“祭祀区” [12] - 大台基、祭祀区、皇城台墓地在皇城台高地上自东向西依次分布，以石墙相隔又以道路相连，共同构成了“居、作、葬”合一的宫城基本轮廓，奠定了河套地区早期宫城结构研究的基础 [12] - 皇城台墓地是石峁文化最高等级墓地，已发掘墓葬110余座，出土大量玉、陶、骨、石等随葬器物 [13] - 墓葬根据殉狗、殉人、棺、壁龛等配置划分等级，等级越高配置越完备，随葬器物越丰富，规模越大 [13] - 高等级墓葬出土的陶明器组合（盉/斝、瓶、盆/壶、杯）和玉器（钺和环）备受关注，其中一件保存完好的鹰纹玉钺刻有繁复的翔鹰和人（神）面形象，是石峁文化遗址出土玉器中最为精美者 [13] - 上述发现是研究石峁和河套社会人群分化、组织结构和文明化进程的重要材料，对于研究中华文明起源和早期国家形成具有重大实证意义 [15]

研究背景与意义 - 石峁遗址是中国目前所知规模最大的史前城址 展现出典型的早期国家形态与高度的社会复杂化特征 但其人群来源、社会结构及与周边人群的关系等科学问题长期存在争议 [1] - 研究团队对来自石峁遗址及周边、晋南地区遗址共169例古代人骨样本 历时13年展开大规模、高分辨率、系统性古DNA研究 [1] 研究成果与突破 - 该研究是全球范围内首次从遗传学角度对如此大规模、高复杂性的史前都邑性遗址进行社会制度和组织结构研究 [2] - 该研究是首次用古DNA重建中国最大规模、具清晰早期国家特征的史前城址的复杂社会组织结构及与亲缘绑定的森严等级制度 [2] - 相关成果论文以"石峁古城古DNA揭秘新石器时代中国地区亲缘关系习俗"为题在国际知名学术期刊《自然》上线发表 [2] 核心遗传学发现 - 研究以确凿遗传学证据 证实石峁文化人群主体源于陕北仰韶晚期人群 确立其文化和人群发展的连续性 [2] - 揭示石峁文化人群与周边陶寺文化人群、北方草原文化人群、南方稻作农业人群之间存在着密切关联 展现出史前农牧业人群广泛的互动交流历史场景 [2] - 精细重建石峁古城内部横跨四代的家族谱系 清晰透视其以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式 [2] 研究价值与影响 - 该研究为理解中国早期国家的形成发展过程提供前所未有的社会组织范本 [2] - 该研究为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶层构成提供首个直接的遗传学证据 [2]

文章核心观点 - 一项历时13年的古DNA研究首次重建了中国最大规模史前城址石峁遗址的复杂社会组织结构 揭示了其人群起源、社会结构及广泛的史前人群互动 [1] - 研究证实石峁文化人群主体源于陕北仰韶晚期人群 确立了其文化和人群发展的连续性 [1] - 研究揭示石峁文化人群与晋南陶寺文化人群、北方裕民成分相关人群、南方稻作农业人群存在密切关联 展现出史前农牧业人群广泛的互动交流 [1] - 研究通过重建石峁古城内部横跨四代的家族谱系 清晰透视其以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式 为理解中国早期国家的形成提供了社会组织范本和首个直接的遗传学证据 [1] - 此项研究成果已于11月27日在《自然》（Nature）杂志上线发表 [2] 研究项目与成果 - 研究由中国科学院古脊椎动物与古人类研究所付巧妹科研团队与陕西省考古研究院等单位合作完成 [1] - 研究历时13年 对来自石峁遗址及周边、晋南地区遗址共169例古代人骨样本展开大规模、高分辨率、系统性古DNA研究 [1] - 研究成果《石峁古城古DNA揭秘新石器时代中国地区亲缘关系习俗》已在《自然》（Nature）杂志上线发表 [2] 未来规划 - 国家文物局考古司副司长张凌表示 下一步将持续推进中华文明探源工程和"考古中国"重大项目 [2] - 未来将加强多学科合作 发挥科技考古支撑作用 不断深化中华文明起源研究 [2]

文章核心观点 - 一项发表于《自然》期刊的古DNA研究，通过对石峁遗址等地的古代人骨样本进行基因组分析，揭示了约4000年前中国北方石峁古城的人群起源、社会结构与权力继承模式，为理解中国早期国家的形成提供了直接的遗传学证据[5] 石峁古城概况 - 石峁古城存在于约公元前2300-1800年，占地面积达4平方公里，相当于560个标准足球场，显示出明显的社会分层和复杂的社会组织[8] - 遗址东城门地基下发现了80多个被献祭的头骨，表明当时已存在高度复杂的宗教仪式[8] 人群起源与基因交流 - 研究通过对169例古代人骨样本的核基因组分析，证实石峁文化人群主体源于4800年前的陕北本地仰韶晚期人群，确立了其文化和人群发展的连续性[4][5][10] - 研究揭示了石峁人群与晋南陶寺文化人群、内蒙古草原的裕民成分人群以及南方稻作农业人群之间存在密切关联，展现了史前农牧业人群广泛的互动交流[5][11] - 从4800年前到3800年前的石峁人群中持续发现了裕民相关的遗传成分，表明与北方草原人群有长期交流，东门祭祀坑中发现的两人具有裕民背景，可能是外来者[11] 社会结构与亲属关系 - 研究精细重建了石峁古城内部横跨四代的家族谱系，清晰透视其以父系亲缘为核心的运行模式[5] - 在高阶墓葬中，男性墓主几乎都携带相同的父系Y染色体单倍型，而母系线粒体单倍型则呈现多样化，表明财产和社会地位主要通过父亲传承[14] - 在石峁文化较高社会地位的家族中，近亲婚配较为少见，可能被有意识规避[15] 丧葬习俗与社会阶层 - 石峁社会存在性别特异性殉葬习俗，外城东门的殉葬者主要是男性（10人中有9人为男性），且多为斩首后集中埋葬，属于公共仪式中的人祭[19] - 在皇城台和寨山等高阶墓地，殉葬者则几乎全是女性，属于贵族死亡后的陪葬，这些女性殉葬者与墓主没有密切亲缘关系，可能来自外部群体，部分女性殉葬者之间存在二级亲缘关系[19] - 基因分析显示社会边界并非完全不可逾越，存在个别精英与低等级个体之间存在亲缘关系的案例，在皇城台墓地发现了两位陪葬品丰富程度不亚于男性精英的高阶女性墓主[21] 研究意义 - 该研究为理解中国早期国家的形成发展过程提供了前所未有的社会组织范本，为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶层构成提供了首个直接的遗传学证据[5] - 研究表明中国早期文明的形成是一个多元融合、本地发展的复杂过程，石峁位于农耕与游牧社会的交汇处，是理解中国北方社会复杂化进程的关键[23]

研究背景与意义 - 石峁遗址是中国目前所知规模最大的史前城址，展现出典型的早期国家形态与高度的社会复杂化特征 [1] - 对于其人群来源、社会结构及与周边人群的关系等科学问题，学界长期存在争议 [1] - 相关研究成果以"石峁古城古DNA揭秘新石器时代中国地区亲缘关系习俗"为题，在国际知名学术期刊《自然》上线发表 [4] 研究方法与样本 - 研究团队对来自石峁遗址及周边、晋南地区遗址共169例古代人骨样本，历时13年展开大规模、高分辨率、系统性古DNA研究 [2] - 通过捕获分析来自陕北仰韶晚期遗址、龙山时期石峁遗址和周边卫星遗址以及晋南遗址共计169例古代人类核基因组 [6] - 该研究是全球范围内首次从遗传学角度对如此大规模、高复杂性的史前都邑性遗址进行社会制度和组织结构研究 [4] - 也是首次用古DNA重建中国最大规模、具清晰早期国家特征的史前城址的复杂社会组织结构及与亲缘绑定的森严等级制度 [4] 人群来源与遗传结构 - 研究证实石峁文化人群主体源于陕北仰韶晚期人群，确立其文化和人群发展的连续性 [4][6] - 石峁主体人群的遗传成分高度一致，均和陕北本地仰韶晚期人群相同 [6] - 石峁文化人群的部分离群个体还携有一定比例的中国北方草原地区人群和南方沿海人群相关祖源成分，显示出石峁人群的多元遗传构成 [8] - 石峁文化与相关人群呈现出"主干清晰、多元交融"的动态形成过程，以当地仰韶人群为稳定的遗传主干，同时与中原、草原和南方的农牧业人群保持着长期互动 [8] - 揭示石峁文化人群与周边陶寺文化人群、北方草原文化人群、南方稻作农业人群之间存在着密切关联，展现出史前农牧业人群广泛的互动交流历史场景 [4] 社会结构与组织模式 - 研究精细重建了石峁古城内部横跨四代的家族谱系 [4] - 清晰透视其以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式 [4] - 研究构建起横跨高达四代的家族谱系，主要建立者均为地位较高男性墓主，其配偶来自不同生物学家族 [9] - 在目前检测的所有石峁文化遗址中，父系的Y染色体单倍型结构较为单一，而母系的线粒体单倍型高度多样 [9] - 相关墓葬空间布局和家庭关系也支持潜在的父系为主导的居住体系 [9] - 为理解中国早期国家的形成发展过程提供前所未有的社会组织范本，为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶层构成提供首个直接的遗传学证据 [4] 研究的开创性意义 - 对石峁古城这种具有超大规模、复杂多样殉葬形式的等级社会的古DNA研究尚属世界首例 [11] - 证实石峁文化主体人群源于陕北本地仰韶晚期居民，为中华文明在本土连续演化提供了坚实遗传证据 [11] - 揭示石峁文化人群与周边陶寺文化人群、草原文化人群、南方稻作农业人群的遗传联系，展现多元文化在史前时期的广泛互动 [11] - 研究揭示石峁遗址人群以父系亲缘为主导的遗传模式，从"人群互动"与"社会结构"两个维度为理解中国早期国家的形成发展过程提供了前所未有的社会组织范本 [11] - 该成果被评价为"揭示了中国早期文明的新证据链"，"在东亚地区开创了运用古DNA方法揭示史前社会阶级分化与人祭现象的研究先河"，"展示出首个国家文明的人群历史与早期社会的遗传结构，对于认识中国乃至整个东亚的早期文明形态具有关键意义" [5]

研究核心发现 - 研究团队历时13年对169例古代人骨样本进行大规模高分辨率核基因组研究 [1] - 研究成果于北京时间11月27日在国际学术期刊《自然》发表 [1] 人群遗传来源与连续性 - 以确凿遗传学证据证实石峁文化人群主体源于陕北仰韶晚期人群确立了其文化和人群发展的连续性 [1] - 证实石峁文化主体人群源于陕北本地仰韶晚期居民为中华文明在本土"连续演化"提供了坚实遗传证据 [7] 史前人群互动交流 - 揭示石峁文化人群与晋南陶寺文化人群、裕民文化人群、南方稻作农业人群之间存在着密切关联 [1] - 展现史前农牧业人群广泛的互动交流历史场景 [1] - 揭示石峁文化人群与周边陶寺文化人群、草原裕民成分相关人群、南方稻作农业人群的遗传联系展现了"多元"文化在史前时期的广泛互动 [8] 社会组织结构与家族谱系 - 精细重建了石峁古城内部横跨四代的家族谱系清晰透视其以父系亲缘为核心构建社会等级的运行模式 [1] - 首次用古DNA重建了中国最大规模具清晰早期国家特征的史前城址的复杂社会组织结构及与亲缘绑定的森严等级制度 [5] - 揭示石峁社会以父系亲缘为主导的遗传模式为探究东亚早期国家起源的权力继承模式、统治家族与社会阶序提供了首个直接的遗传学证据 [7][8] 遗址背景与研究意义 - 石峁遗址地处黄土高原与毛乌素沙漠的交界带是中国已知规模最大的史前城址展现出典型的早期国家形态与高度的社会复杂化程度 [3] - 该研究为理解中国早期国家的形成发展过程提供了前所未有的社会组织范本对于认识中国乃至整个东亚的早期文明形态具有关键意义 [1] - 这些发现深化了对早期国家形态和中华文明早期发展路径的认识为探索中华文明"多元一体"格局形成过程具有重要意义 [8]

基因组学研究突破 - 国际学术期刊《自然》发表论文称研究人员从上埃及Nuwayrat地区古王国墓葬中提取到一名古埃及个体的全基因组测序数据 这些数据可追溯至古埃及第三至第四王朝(公元前2686-前2125年) [1] - 该研究揭示古埃及个体与北非及中东地区(包括美索不达米亚)古人群的亲缘关系 为早期埃及人的遗传多样性研究提供了新线索 [1] - 此前数十年研究对古埃及人整体理解有所增进 但对其遗传构成了解不多 迄今只有3个古埃及个体的基因组得到部分测序 [1] 研究样本与方法 - 研究分析一名男性个体的新测序基因组 放射性碳测年为修正后公元前2855-前2570年左右 与埃及早王朝末尾及古王国时期起始重叠 [2] - 该个体被发现埋葬于Nuwayrat的密封陶罐中 社会地位较高 年龄在44-64岁之间 [2] - 从7个DNA样本中筛选出2个保存完好的样本进行测序 并与3233个现代个体和805个古代个体的数据库进行对比分析 [2] 研究发现 - 通过遗传模拟 将该Nuwayrat个体基因组的绝大部分追溯到北非新石器时代的祖先 [2] - 约20%基因组与东新月沃土(Fertile Crescent)相关 补充了两个地区有贸易往来和相互影响的现有考古学证据 [2] - 研究发现推动了对古王国时期埃及人的理解 并揭示了可能有利于古DNA保存的埋葬条件 [3]

丹尼索瓦人研究突破 - 科学家基于遗传学发现丹尼索瓦人，现今东亚人和大洋洲人基因中有其遗传痕迹[2] - 中国科学院与河北地质大学团队确认距今至少14.6万年的哈尔滨古人类头骨属于丹尼索瓦人支系[2] - 研究成果分别发表于《科学》和《细胞》杂志[2] 研究技术突破 - 建立古蛋白全自动化鉴定人群方法体系，产生迄今最高质量古人类蛋白组数据[5] - 创新性从0.3毫克牙结石中提取到丹尼索瓦人特有线粒体DNA[5] - 古蛋白与古DNA研究互为印证，首次将完整头骨与丹尼索瓦人分子证据关联[5] 形态学发现 - 哈尔滨头骨化石被命名为"龙人"，与青藏高原丹尼索瓦下颌骨存在显著相似性[3] - 研究揭示了丹尼索瓦人较完整的头骨形态特征[4] - 为识别东亚其他可能属于丹尼索瓦人的化石(如大荔人、金牛山人等)提供参照[5] 学术价值 - 破解了丹尼索瓦人形态之谜，为其时空分布研究提供重要证据[4] - 证实丹尼索瓦人在中更新世晚期已广泛分布于西伯利亚和东亚北部[6] - 为后续中晚更新世古人类遗传学研究提供了范本[6]

古人类研究突破 - 付巧妹团队在2025年6月18日同时发表3篇顶刊论文，创下科研纪录[2] - 研究基于哈尔滨发现的≥14.6万年人类头骨化石，首次明确丹尼索瓦人外貌特征[4] - 通过古蛋白和古DNA双重验证技术，确认该头骨属于丹尼索瓦人种群[4][6] 关键技术方法 - 从头骨化石提取95种古蛋白片段，发现丹尼索瓦人特异性序列[24] - 首次从旧石器时代牙结石中成功提取宿主线粒体DNA[25] - 开发的新型古遗传学方法为中更新世研究开辟新途径[29] 学术争议与进展 - 河北地质大学2021年曾将该头骨命名为"龙人"新物种[22] - 形态学显示与甘肃丹尼索瓦人下颌骨存在显著相似性[24] - 分子证据最终确认其属于早期丹尼索瓦人分支[26] 化石发现历程 - 头骨化石1933年发现于哈尔滨，曾被秘密保存85年[20] - 2018年捐赠给河北地质大学，铀系测年≥14.6万年[21] - 是目前最完整的古人类化石之一，体积为人属最大[21] 丹尼索瓦人研究脉络 - 2010年首次通过西伯利亚指骨mtDNA发现该人种[8] - 2019年甘肃下颌骨成为首例洞穴外发现的丹尼索瓦人化石[11] - 2025年台湾澎湖下颌骨通过4241个氨基酸残基鉴定为男性个体[15]

龙人头骨化石的发现与研究 - 1933年哈尔滨建筑工人发现保存完整的古人类头骨化石，铀系测年显示其年代不晚于14.6万年[2] - 2021年研究团队在The Innovation期刊发表3篇论文，将该头骨命名为"龙人"(Homo longi)，认为其代表全新古人类支系[2] 学术争议与丹尼索瓦人关联 - 学术界对龙人是否为全新支系存在争议，形态学显示其与青藏高原丹尼索瓦人下颌骨相似，但缺乏直接遗传证据[4] - 丹尼索瓦人遗骸普遍残破，龙人头骨可能提供首个完整形态与遗传学关联的突破性证据[5] 古DNA技术突破性研究 - 2025年Cell论文首次从龙人牙结石中提取丹尼索瓦人线粒体DNA，技术优化包括： - 使用0.3mg牙结石样本构建20个DNA文库，筛选出7个含特异性变异的文库[10] - 开发污染评估方法剔除82%现代人污染，仅分析<60bp的短片段数据[10] - 自主算法构建祖先型参考序列减少比对误差[10] 遗传学与年代学分析结果 - 龙人线粒体DNA显示其属于丹尼索瓦人早期分支，与西伯利亚18.7-21.7万年前的个体更接近[11] - 年代学支持龙人(≤14.6万年)与丹尼索瓦洞穴早期个体(12.3-21.7万年)的关联性[11] 研究的多重科学意义 - 首次实现丹尼索瓦人遗传信息与近完整头骨形态的直接关联[13] - 验证牙结石作为中更新世古DNA载体的潜力，开辟新技术途径[14] - 证明丹尼索瓦人在中更新世晚期已广泛分布于西伯利亚至中国东北[14]