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长链非编码RNA(lncRNA)
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这篇重磅Cell论文发表一年后,作者主动申请撤稿
生物世界· 2025-12-04 00:25
文章核心观点 - 一篇于2024年11月发表在顶级期刊《Cell》上的重要研究论文,因发现其使用的CRISPR筛选文库存在未过滤脱靶序列的重大技术缺陷,于2025年12月被作者团队主动申请撤稿[2][3][6][8] 研究背景与科学问题 - 人类基因组中仅有2%编码蛋白质,其余98%为非编码序列,其功能在很大程度上未知[2] - 长链非编码RNA是广泛转录的非编码RNA,但在已注释的lncRNA中,只有极少数(<1%)具有明确的功能作用[2] - 了解非编码基因组区域的功能是人类遗传学的一个紧迫问题[2] 原研究的技术方法与宣称发现 - 原研究开发了一种基于CRISPR-Cas13的靶向RNA的转录组规模筛选技术[3][4] - 该技术旨在克服基于Cas9的CRISPRi/a技术可能存在的上靶活性及干扰附近DNA元件的局限性[3] - 研究使用该技术在5种人类细胞中筛选,宣称鉴定了778个必需的lncRNA[4] - 该发现表明许多lncRNA并非“垃圾”,且在人类癌症和发育中可能发挥必不可少的作用[4] - 该筛选工具被描述为具有广泛适用性,不仅限于lncRNA,还可应用于其他非编码RNA如增强子RNA和环状RNA的筛选[4] 撤稿原因与后续进展 - 撤稿的直接原因是作者发现用于靶向lncRNA和蛋白编码转录本的混合CRISPR筛选文库,未经过滤以去除人类转录组中其他位置可能存在的脱靶序列[8] - 在收到同行提醒后,作者对数据进行了重新分析,移除了与蛋白编码转录本或lncRNA存在最多2个错配的向导RNA以过滤潜在脱靶[8] - 重新分析及更新实验后,所鉴定出的必需lncRNA发生了变化,导致原论文结论无法成立[9] - 作者因此决定撤回论文,并将更新后的分析与实验以预印本形式发布[9][11]