文章核心观点 - 浙江大学联合华为等公司研发出基于AI的棉花育种智能体“AI育种家”，该技术将棉花杂交育种组合效率提升20倍，并将育种周期从6-8年压缩到3-4年 [1] 技术研发与合作 - 成果由浙江大学张天真团队携手华为技术有限公司、北京大蚯蚓数字科技有限公司联合研发 [1] - 团队构建了全球首个棉花多组学数据库平台COTTONOMICS，该平台基于对全球5000余个棉花品种的系统分析，解析了79642个基因，鉴定出1000多个和产量、品质相关的基因位点 [1] - COTTONOMICS平台3年来访问量已超9万次 [1] - 联合团队构建了覆盖全部棉花优异基因的核心种质库，并研发出全基因组选择育种液相芯片“浙大棉芯” [1] 平台功能与应用 - “AI育种家”具备智能解析植株表型并输出直接结果的能力，采用对话式交互设计，支持基因信息检索、精准育种方案生成及后代性状预测 [1] - 育种人员可直接输入问题查询品种的高产、优质或抗病基因，平台可迅速调出结果 [2] - 输入目标性状后，系统能快速生成棉花杂交亲本选配或基因聚合育种的最优方案 [2] 技术扩展性 - “AI育种家”在设计之初具备多作物扩展能力，正逐步延伸应用于水稻、大豆、油菜、西瓜、西蓝花等作物的育种研究 [2]

数据库发布 - 中国农业科学院郑州果树研究所桃遗传育种团队开发了PeachMD数据库 首次集成桃基因组、表观遗传组、群体遗传变异及多维度表型数据 [1] - 数据库深度整合CRISPR设计、GWAS分析等工具 为桃分子育种和功能基因组学研究提供数据支持 [1] - 数据库网址为http://www.peachmd.com [1] 数据规模 - 包含12个桃基因组 支持基因组间共线性分析 [4] - 整合329个转录组数据集 包括不同组织和发育阶段 支持FPKM/TPM/Read Count多维度表达谱分析 [4] - 收集102个全基因组亚硫酸氢盐测序数据 可解析CG/CHG/CHH不同位点甲基化调控模式 [4] - 包含1313个全基因组重测序数据 涵盖13类关键农艺性状表型 [4] 技术特点 - 采用全过程式设计理念 通过CRISPR-GWAS联动实现从基因挖掘到分子设计全流程覆盖 [5] - 支持多模式检索 可从基因ID、启动子、蛋白结构域等多维度查询 [5] - 集成Gene LiftOver工具 方便不同基因组间的基因比较 [5] - 提供多组学关联分析工具 可揭示基因组变异-表观变异-转录差异协同调控网络 [5] 行业背景 - 高通量测序技术快速发展 测序成本显著降低 生物大数据呈指数级增长 [3] - 多组学技术广泛应用 催生基因组、转录组、表观组等多维度海量数据资源 [3] - 数据积累为解析桃进化历程、挖掘关键基因和指导分子育种提供新机遇 [4]