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华大最新Cell论文:时空组学新技术,破解FFPE样本难题,看清宿主-微生物“战场全景”
生物世界·2025-08-29 11:50

技术突破 - 推出全新空间转录组技术Stereo-seq V2 首次实现对FFPE样本的全域、高分辨率、原位宿主-微生物共分析 推动生命科学研究从看见细胞迈入看清细胞与微生物战场的精准时代[4] - 通过创新解交联技术加随机引物捕获策略突破FFPE样本RNA完整性差的核心瓶颈 可分析保存长达9年的乳腺癌FFPE样本并清晰绘制肿瘤基因表达空间图谱[8] - 采用随机引物替代传统poly(T)引物 实现无偏好捕获全转录组RNA 使检测到的基因数量大幅增加并实现基因全长均匀覆盖 精准鉴定肿瘤特异性可变剪接事件[10] 应用场景 - 肿瘤精准医疗中识别与预后相关的基因拷贝数变异及耐药相关的新剪接异构体 为个性化治疗方案制定提供依据[17] - 感染性疾病领域无需提前知晓病原体种类即可直接定位疑难感染的病原体位置并评估宿主免疫反应 指导精准用药[25] - 抗体药物研发中快速定位病原体特异性中和抗体克隆 大幅加速抗体药物筛选效率[25] 临床价值 - 解锁临床中超过90%的FFPE样本 将全球医院病理科积压样本库高效转化为前沿研究数据源 为临床回顾性研究提供前所未有的可能[8] - 在结核杆菌感染模型中精准绘制病原体在肺部随时间扩散的动态分布图 明确病原体藏身据点并在空间原位发现针对结核杆菌的特异性B细胞克隆[15][19] - 对珍贵存档脑组织样本进行高分辨率空间图谱分析 为神经科学和发育生物学研究打开新窗口[25] 行业影响 - 中国科研团队在Cell期刊发布Stereo-seq V2技术 破解FFPE样本难题并解锁宿主-微生物互作奥秘 持续为生命科学领域提供原创性中国工具和中国方案[21] - 该技术作为强大的生命数据引擎 推动基础研究、临床诊断和新药研发进入更精准、更全面、更原位的空间多组学时代[21]